La Escuela Náutica de Panamá fue fundada en 1958, y en ese momento se dedicó exclusivamente a formar marinos polivalentes hasta 1971, cuando se establecieron las carreras de Oficiales de Cubierta y de Máquina. En 1972, se considera la demanda de Oficiales de Marina Mercante Internacional y las posibilidades de empleo en el Canal de Panamá, por lo tanto, se amplió la oferta académica a nivel universitario e incluyen carreras conducentes a Oficiales de Marina Mercante.
La UMIP se enfoca fundamentalmente en formar gente de mar especializada en las áreas del clúster marítimo portuario, marino costero nacional y regional y la flota mercante mundial. La UMIP es una universidad única en su género, pues se enfoca en la capacitación para la vida y el trabajo, a través de la gestión del conocimiento y el énfasis en el liderazgo, la disciplina, la responsabilidad, las competencias y los valores que habilitan al estudiante para desenvolverse y tener éxito en el conglomerado de la industria marítima portuaria y marina costera mundial.